تُعد وكالة الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي بجامعة الجوف من أهم الوحدات الإدارية في الجامعة، حيث تُعنى بتطوير ودعم برامج الدراسات العليا والبحث العلمي في الجامعة، وفي سبيل الارتقاء بالعملية البحثية تقوم الوكالة بتوفير الكوادر البشرية المؤهلة والحصول على مصادر تمويل مالية دائمة ومتنوعة للأبحاث العلمية، كما استحدثت الوكالة عدد من برامج الدراسات العليا في تخصصات متنوعة، وتسعى الوكالة إلى تحقيق أهدافها من خلال:

• تطوير برامج الدراسات العليا في الجامعة من خلال إجراء الدراسات والبحوث اللازمة، ومراجعة المناهج والخطط الدراسية، وتوفير الإمكانات اللازمة للطلاب والطالبات. كما تسعى الوكالة إلى ضمان جودة برامج الدراسات العليا من خلال تطبيق معايير الجودة العالمية، وإجراء عمليات التقييم المستمرة للبرامج.
• توفير الدعم المالي والإداري للباحثين في الجامعة، والمساهمة في نشر مخرجات البحث العلمي، وتسويقها للجهات ذات العلاقة. كما تُنظم الوكالة العديد من البرامج والفعاليات التي تُعزز البحث العلمي في الجامعة، مثل المؤتمرات والندوات العلمية، وورش العمل البحثية.
• نشر مخرجات البحث العلمي من خلال إصدار المجلات العلمية المحكمة، وعقد الاتفاقيات مع دور النشر العالمية، وتنظيم المعارض العلمية. كما تُساهم الوكالة في نشر مخرجات البحث العلمي في وسائل الإعلام المختلفة.
• إقامة علاقات تعاون مع الجهات المحلية والدولية في مجال البحث العلمي، وذلك من أجل تعزيز التعاون وتبادل الخبرات في هذا المجال. كما تُشارك الوكالة في المؤتمرات والندوات العلمية الدولية، وتُنظم زيارات علمية للباحثين من مختلف دول العالم.