- كلية الطب - كلية طب الاسنان - كلية العلوم الطبية والتطبيقية - كلية العلوم الصحية - كلية الصيدلة

- كلية الهندسة - كلية علوم الحاسوب والمعلومات - كلية العلوم - كلية العلوم والاداب

- كلية العلوم الادارية والانسانية - كلية التربية

- كلية المجتمع بالقريات - كلية المجتمع بسكاكا

- مدير الجامعة - وكيل الجامعة - وكيل الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي - أمانة مجلس الجامعة

- عمادة القبول والتسجيل - عمادة شئون الطلاب - عمادة شئون المكتبات - عمادة السنة التحضيرية - عمادة التعليم الالكتروني والتعليم عن بعد - عمادة الجودة والاعتماد الاكاديمي - عمادة شئون أعضاء هيئة التدريس والموظفين

- الادارة العامة لتقنية المعلومات - الادارة العامة للشئون المالية والإدارية - الادارة العامة للشئون الفنية والخدمات العامة - إدارة العلاقات العامة والاعلام الجامعي - مركزالتدريب وخدمات المجتمع - إدارة المتابعة - إدارة المشتريات - إدارة مراقبة المخزون - الادارة العامة للمشاريع - الادارة القانونية - إدارة المستودعات