كان البدء لإنشاء الكلية خطاب معالي وزير التعليم العالي رقم6/1/ 21191 وتاريخ 12/8/ 1425 هـ المتضمن رغبة الوزارة بافتتاح كليات جامعية جديدة ومنها كلية العلوم الطبية التطبيقية بالجوف. بعد ذلك أوصى مجلس جامعة الجوف بجلسته الرابعة المنعقدة بتاريخ (23/11/ 1425 هـ) بالموافقة على المذكرة المرفوعة من وكالة الجامعة للشؤون التعليمية والأكاديمية بشأن التوصية بتحويل قسم علوم المختبرات الطبية بكلية العلوم بالجوف إلى كلية للعلوم الطبية التطبيقية، ثم بعد ذلك صدرت موافقة خادم الحرمين الشريفين رئيس مجلس الوزراء ورئيس مجلس التعليم العالي بالتوجيه البرقي الكريم رقم 7710/م ب وتاريخ 7/6/ 1426 هـ ، على قرار مجلس التعليم العالي رقم 9/36/26 في جلسته (السادسة والثلاثين) المعقودة بتاريخ 26/2/1426 هـ القاضي بالموافقة على تحويل قسم علوم المختبرات الطبية بكلية العلوم بالجوف التابعة لجامعة الجوف إلى كلية العلوم الطبية التطبيقية وقد تم بدء الدراسة بالكلية في الفصل الثاني للعام الدراسي 1426/ 1427 هـ .